Dentro do corpo o vírus se aloja no sistema digestivo e infecta as células do estômago, ali ele se reproduz e rompe a célula, caindo novamente no sistema digestivo. As células ficam danificadas e incapazes de realizar sua função.

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             O vírus geralmente pode acometer a resposta imune inata, devido a sua replicação. Com a ativação da reposta adaptativa, desencadeia a resposta dos linfócitos TCD8+, sendo potencializada pelo TCD4. São processados por APC’s, preferencialmente por celular dendríticas.

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              Os PRR’s reconhecem os PAMP’s, onde ocorre a endocitose e a fagocitose. Dependendo do vírus, às imunoglobulinas IgA, IgM e IgG agem no organismo, bloqueando a sua replicação.

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               Como o vírus é altamente resistente, ocorre a virem sistêmica. Em ambiente onde o vírus é resiste, há altas taxas de replicação, como por exemplo o picornavirus que é resistente a pH altamente ácido do trato gastrointestinal. Podem causar necrose das criptas do epitélio no intestino delgado, como é o caso do parvovirus.